Hay algunos microarreglos estándares para su uso en la investigación del cáncer, como por ejemplo, el Linfochip (Lymphochip, en inglés). Los arreglos estándares incluyen a genes que han sido reportados como importantes en un cierto tipo de cáncer. Otros arreglos contienen cadenas de ADN conocidas como polimorfismos de nucleótido único (single nucleotide polymorphisms, SNPs o "snips", en inglés), los cuales son variaciones comunes en el ADN. Los investigadores también pueden crear sus propios microarreglos utilizando cualquier gen (o fragmentos de gen) que ellos piensen que podría ser importante a las preguntas que ellos están tratando de contestar.