Las supresiones o inserciones grandes en un cromosoma también pueden conducir al cáncer. Esto puede ocurrir durante la mitosis o durante la recombinación en la meiosis. Las translocaciones ocurren cuando los segmentos de un cromosoma se desprenden y se fusionan a un cromosoma diferente, sin pérdida alguna de material genético. Se ha encontrado que muchas de éstas permiten el desarrollo de tumores. Las inversiones son mutaciones que se originan cuando dos rupturas ocurren en un cromosoma y la pieza se reinserta en orden inverso. Otras anormalidades cromosomales incluyen la no disyunción, el fracaso de los homólogos (pares de cromosomas) para separarse a medida que las nuevas células se dividen.