Secuenciación del ADN de tumores en el tratamiento de cáncer

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La secuenciación del ADN de tumores puede identificar cambios únicos del ADN que podrían ayudar a los doctores a determinar el tratamiento óptimo para el cáncer de un paciente.

Crédito: Darryl Leja, NHGRI

¿Qué es la secuenciación clínica del ADN de tumores?

El cáncer es una enfermedad genética; es decir, es causado por cambios en los genes que controlan la forma como funcionan las células, especialmente la forma como crecen y se dividen. Estos cambios pueden ser heredados, pero la mayoría surgen al azar a lo largo de la vida de una persona, ya sea como resultado de errores que ocurren al dividirse las células o por exposición a carcinógenos que dañan al ADN.

El cáncer de cada persona tiene una combinación única de cambios genéticos, y la secuenciación del ADN de los tumores —llamada algunas veces perfil genético o pruebas genéticas— es un análisis para identificar estos cambios únicos del ADN.

En algunos casos, conocer las alteraciones genéticas en su cáncer puede ayudar a determinar un plan de tratamiento. Algunos tratamientos — en especial algunas terapias dirigidas— son eficaces solo para personas cuyas células cancerosas tienen alteraciones genéticas específicas que causan que las células crezcan sin control (estas se llaman algunas veces mutaciones “impulsoras”).

Por ejemplo, las mutaciones en el gen EGFR que hacen que las células se dividan con rapidez se encuentran en las células cancerosas de pulmón de algunas personas. El paciente cuyas células cancerosas de pulmón albergan una mutación en EGFR puede responder al tratamiento con fármacos llamados inhibidores de EGFR. La secuenciación clínica del ADN de los tumores puede revelar si el tumor de pulmón de un paciente tiene una mutación en EGFR.

La secuenciación del ADN de tumores está en el centro de la medicina de precisión: tratamiento diseñado de acuerdo a las características moleculares de la enfermedad de cada paciente.

¿Cómo puedo saber si la secuenciación del ADN del tumor es adecuada para mí?

Consulte a su proveedor de servicios médicos para discutir la posibilidad de la secuenciación del ADN del tumor como parte de su tratamiento. La secuenciación del ADN de tumores es más común (y más beneficiosa) para pacientes con tipos de cáncer que puedan ser susceptible de tratamiento con una terapia dirigida. Estos pacientes suelen ser examinados para la mutación genética a la que se dirige la terapia. Por ejemplo, las pruebas genéticas son una parte rutinaria para el tratamiento del cáncer colorrectal y del cáncer de pulmón.

Además, algunos oncólogos pueden recomendar la secuenciación del ADN de tumores para pacientes con cáncer avanzado que no responde al tratamiento convencional o para el que no hay disponible un tratamiento convencional. Esto puede ayudar a identificar otros tratamientos que podrían ser eficaces dada la composición genética del cáncer.

En otros casos, la secuenciación del ADN de tumores puede estar a su disposición si usted participa en un estudio clínico que incluye una prueba de secuenciación. Varios estudios en curso de medicina de precisión, como MATCH y MATCH Infantil, están usando la secuenciación del ADN de tumores para asignar a los pacientes a tratamientos en investigación según las alteraciones genéticas en sus tumores.

¿Cómo se hace la secuenciación del ADN de tumores?

Si usted y sus proveedores de servicios médicos deciden hacer que la secuenciación del ADN de su tumor sea parte de su tratamiento, ellos extraerán una muestra de su tumor y, en algunos casos, una muestra de sus células sanas. Ellos pueden obtener estas muestras durante la cirugía, si es parte de su plan de tratamiento. En otros casos, usted puede necesitar tener una biopsia.

Sus muestras se enviarán a un laboratorio especializado, en donde los investigadores aislarán su ADN y luego usarán una máquina llamada secuenciador de ADN para “leerlo”. Ellos analizarán luego la secuencia de su ADN para determinar si hay alguna alteración genética que haga susceptible a su tumor para ciertos tratamientos. Ellos pueden examinar también la secuencia del ADN de sus células sanas para determinar si tienen algunas mutaciones heredadas, o de estirpe germinal, que aumenten su riesgo de cáncer y pueden influir también en las decisiones de tratamiento.

Basándose en las alteraciones genéticas únicas de su tumor, el laboratorio especializado puede generar un informe que incluya las listas de tratamientos a los que su tumor tiene probabilidad de responder. Su equipo de servicios médicos discutirá los resultados con usted para tomar una decisión personalizada del tratamiento.

¿Qué clases de pruebas de secuenciación hay disponibles?

Las pruebas de secuenciación del ADN pueden tener un enfoque amplio o concentrado. Las pruebas concentradas de secuenciación del ADN, también llamadas paneles de muchos genes, son las pruebas de secuenciación que se usan con más frecuencia para el tratamiento de pacientes. Estas pruebas analizan mutaciones “impulsoras” específicas. Algunas pruebas concentradas de secuenciación analizan alteraciones que son comunes en un solo tipo de cáncer, mientras que otras analizan alteraciones que pueden encontrarse en muchos tipos de cáncer.

Las pruebas amplias de secuenciación del ADN analizan la secuencia de zonas grandes del ADN más bien que mutaciones específicas. Por ejemplo, la secuenciación de todo el genoma lee la secuencia de todo el ADN en sus células cancerosas, lo que se conoce como genoma. Otra prueba amplia, llamada secuenciación de todo el exoma, lee la secuencia de todos sus genes, lo que se conoce como exoma. La mayoría de los cambios del ADN que causan cáncer ocurren en los genes, pero los cambios en el ADN afuera de los genes pueden impulsar también el crecimiento de cáncer. Ya que las pruebas de todo el genoma y de todo el exoma no se han comparado directamente, no está claro si un tipo de prueba es más beneficioso para los pacientes.

Además, una prueba cuantitativa de la expresión de ARNm puede también reunir información acerca de los tratamientos que podrían funcionar mejor para usted. Por ejemplo, una prueba cuantitativa de ARNm que se usa con frecuencia para el tratamiento de cáncer analiza 21 genes diferentes que pueden causar cáncer de seno y predice si una paciente con cáncer de seno tiene probabilidad de beneficiarse con tratamiento de quimioterapia

¿Qué significan los resultados de una prueba de secuenciación del ADN de un tumor?

Las pruebas de un panel de muchos genes indican claramente si usted tiene una alteración genética en su tumor que puede ser puesta en el blanco de una terapia existente. Ya que las pruebas amplias de secuenciación del ADN de tumores analizan más regiones del ADN, su interpretación puede ser más difícil. Por ejemplo, pueden identificar alteraciones genéticas que no causan cáncer (benignas) o cuyos efectos no se conocen (de significado desconocido). Las alteraciones que son benignas o de significado desconocido no ayudan en el tratamiento de pacientes.

Las pruebas de secuenciación del ADN de tumores pueden descubrir también la presencia de alteraciones heredadas que aumentan el riesgo de cáncer o que están asociadas con enfermedades o padecimientos que no son cáncer. Estos se conocen como resultados incidentales o secundarios. Al saber que usted lleva una alteración genética heredada puede tener implicaciones no solo para usted, sino también para sus parientes consanguíneos. Por esta razón, es importante consultar a un asesor genético que ayude a interpretar los resultados de las pruebas de secuenciación del ADN.

¿Cuáles son las limitaciones de las pruebas de secuenciación del ADN de tumores?

Las pruebas genéticas no benefician a todos los pacientes. Por ejemplo, podrían no identificar la alteración del ADN que está impulsando el crecimiento de su tumor. O, es posible que encuentren tal alteración pero que no pueda ser atacada con las terapias existentes. Y, aun cuando usted tenga una alteración que pueda ser atacada por una terapia existente, otros aspectos únicos de su biología (como el modo en que su cuerpo desintegra un fármaco) puede influir en la forma como usted responde a la terapia.

Otra limitación es que los tumores se componen de células cancerosas con alteraciones genéticas variadas o heterogéneas. Por esta razón, una muestra pequeña de células cancerosas que se obtienen de una biopsia puede no representar con precisión el tumor heterogéneo. Esto puede significar que las pruebas de secuenciación del ADN pueden identificar un posible tratamiento que puede actuar contra algunas de sus células cancerosas, pero no contra todas. Las células cancerosas a las que no ataca el tratamiento tienen la posibilidad de seguir creciendo, lo que causa que regrese el tumor.

Además, las alteraciones genéticas en un tumor pueden cambiar con el tiempo, pero una prueba de secuenciación solo capta una “instantánea” de las alteraciones presentes en un lapso. Esto significa que los resultados de una prueba de secuenciación que se obtuvieron hace un año pueden no reflejar con precisión las alteraciones genéticas presentes en sus células cancerosas en este momento.

¿Cuánto cuesta la secuenciación del ADN de un tumor?

El costo de la secuenciación del ADN de un tumor varía según el tipo de prueba. Por ejemplo, una prueba comercial que analiza las alteraciones genéticas en más de 300 genes para pacientes con tumores sólidos cuesta en la actualidad USD 5,800.

Las pruebas clínicas de secuenciación de todo el exoma cuestan entre USD 1,000 y UDS 5,000, y la secuenciación de todo el genoma podría costar más de USD 10,000. Sin embargo, las compañías biotecnológicas están formulando constantemente técnicas más rápidas y menos caras de secuenciación que podrían eventualmente hacer bajar los precios.

La cobertura del seguro médico de la secuenciación del ADN de tumores depende de su proveedor de seguro y del tipo de cáncer que usted tiene. Las compañías de seguro suelen cubrir las pruebas de secuenciación del ADN si hay evidencia suficiente para sostener que la prueba es necesaria para guiar el tratamiento del paciente. Las pruebas sin suficiente evidencia que apoye su utilidad pueden considerarse experimentales y es probable que no las cubra el seguro.

Muchos estudios clínicos implican la secuenciación del ADN de tumores. Si usted participa en uno de estos estudios clínicos, el costo de la secuenciación del tumor podría estar cubierto. El coordinador del estudio puede darle más información acerca de los costos correspondientes.

  • Publicación: 6 de octubre de 2017

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